Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms