Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms