Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC174Q6PII3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms