Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms