Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms