Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms