Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb6Q60692 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Psmb6Q60692 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms