Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46CQ5VWP2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46CQ5VWP2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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