Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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