Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms