Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD3Q5JV73 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms