Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN4Q5BKX8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms