Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EIPR1Q53HC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EIPR1Q53HC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EIPR1Q53HC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EIPR1Q53HC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EIPR1Q53HC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms