Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms