Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms