Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms