Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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