Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC57Q2TAC2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms