Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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