Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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