Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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