Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA4Q16363 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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