Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms