Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms