Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CCDC85BQ15834 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CCDC85BQ15834 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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