Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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