Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME4Q14997 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME4Q14997 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms