Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms