Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms