Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
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