Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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