Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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