Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSPB3Q12988 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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