Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms