Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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