Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD47Q08722 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms