Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOS1Q07889 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms