Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms