Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPCQ01831 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPCQ01831 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPCQ01831 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPCQ01831 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms