Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAP1Q01518 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms