Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA4Q00056 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA4Q00056 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms