Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FGD1P98174 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD1P98174 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms