Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms