Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK1P57059 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK1P57059 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK1P57059 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK1P57059 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms