Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AFDNP55196 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFDNP55196 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFDNP55196 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFDNP55196 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms