Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMTNP53814 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms