Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUCLG1P53597 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUCLG1P53597 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms