Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms