Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DAP3P51398 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms