Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK2P49760 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms